Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PRPF4BQ13523 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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