Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SEMA3FQ13275 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SEMA3FQ13275 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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SEMA3FQ13275 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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SEMA3FQ13275 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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