Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CALCOCO2Q13137 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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CALCOCO2Q13137 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CALCOCO2Q13137 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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CALCOCO2Q13137 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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