Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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