Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms