Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTPRBP23467 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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