Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTPRAP18433 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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