Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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