Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms