Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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