Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOGA3Q5TF21 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOGA3Q5TF21 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms