Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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