Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Q1T7F1 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Q1T7F1 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Q1T7F1 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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