Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SGCBQ16585 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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