Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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CNGA3Q16281 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CNGA3Q16281 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CNGA3Q16281 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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CNGA3Q16281 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGA3Q16281 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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