Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SYCP1Q15431 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SYCP1Q15431 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SYCP1Q15431 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SYCP1Q15431 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SYCP1Q15431 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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