Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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