Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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RAB39AQ14964 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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RAB39AQ14964 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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RAB39AQ14964 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RAB39AQ14964 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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