Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms