| CHD4 | Q14839 | AL022578.1-201 | ENST00000439330 | 1433 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL136537.2-201 | ENST00000562049 | 2471 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | PYGO1-201 | ENST00000302000 | 8488 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | PDCL2-201 | ENST00000295645 | 861 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MYO16-AS2-201 | ENST00000412809 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL358075.3-201 | ENST00000426289 | 226 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | TCF7L1-IT1-201 | ENST00000433581 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | HMGN2P21-201 | ENST00000447764 | 270 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC108752.1-203 | ENST00000496674 | 339 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTND2P38-201 | ENST00000522536 | 667 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC090857.2-201 | ENST00000526362 | 723 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL352984.1-201 | ENST00000556949 | 276 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC091489.2-201 | ENST00000566263 | 604 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR4448-201 | ENST00000584360 | 86 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC012594.1-269 | ENST00000600489 | 628 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC01206-214 | ENST00000610910 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL354810.1-201 | ENST00000618134 | 635 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC009268.2-201 | ENST00000621925 | 457 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AP003171.2-202 | ENST00000634657 | 355 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | PHF3-202 | ENST00000393387 | 6947 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | ANGPTL3-201 | ENST00000371129 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | GPR34-201 | ENST00000378138 | 1815 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-374P-201 | ENST00000364146 | 108 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-1-201 | ENST00000383898 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-42P-201 | ENST00000384165 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-36P-201 | ENST00000384172 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-4P-201 | ENST00000384205 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-5P-201 | ENST00000384238 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-3P-201 | ENST00000384314 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | Y_RNA.493-201 | ENST00000384422 | 102 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-2-201 | ENST00000384627 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-9-201 | ENST00000384776 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-33P-201 | ENST00000384793 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNA5SP56-201 | ENST00000410277 | 118 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTATP6P17-201 | ENST00000431030 | 672 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC104653.2-201 | ENST00000435407 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AP002512.3-201 | ENST00000440231 | 985 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | PGBD4P3-201 | ENST00000440731 | 581 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | PCCA-AS1-203 | ENST00000455958 | 356 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | NCOR1P1-202 | ENST00000486162 | 291 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC023424.2-201 | ENST00000493479 | 777 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC022447.3-201 | ENST00000506865 | 495 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | HMGB1P28-201 | ENST00000507778 | 552 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | TBCAP3-201 | ENST00000512475 | 312 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | SCARNA16.3-201 | ENST00000516595 | 184 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC087373.1-201 | ENST00000524920 | 491 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC02286-201 | ENST00000552425 | 285 nt | TSL 2 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | LRRC37A5P-203 | ENST00000580181 | 585 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | TEX41-222 | ENST00000597173 | 1134 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL23AP78-201 | ENST00000599928 | 470 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-6P-201 | ENST00000606623 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC007494.3-201 | ENST00000624660 | 743 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNY4P24-201 | ENST00000362735 | 96 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | Y_RNA.97-201 | ENST00000363094 | 102 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | Y_RNA.178-201 | ENST00000363832 | 102 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-335P-201 | ENST00000364563 | 113 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | Y_RNA.295-201 | ENST00000364918 | 102 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTND3P17-201 | ENST00000416968 | 344 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC098592.1-201 | ENST00000419352 | 333 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL645937.4-201 | ENST00000419702 | 389 nt | TSL 2 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL390962.1-201 | ENST00000421507 | 526 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL353777.1-201 | ENST00000425552 | 326 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | THAP5P1-201 | ENST00000439089 | 262 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC002381.1-201 | ENST00000447049 | 280 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC007557.1-201 | ENST00000451711 | 541 nt | TSL 2 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL23AP55-201 | ENST00000498163 | 452 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTND1P22-201 | ENST00000510572 | 951 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC010486.3-201 | ENST00000511602 | 785 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-759P-201 | ENST00000516740 | 103 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC026991.1-201 | ENST00000520815 | 463 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL356057.1-201 | ENST00000533798 | 831 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | SETP7-201 | ENST00000552169 | 453 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC087481.2-201 | ENST00000565492 | 330 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | SNORD84-203 | ENST00000584275 | 78 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC091925.2-201 | ENST00000625059 | 256 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | SOX2-OT-255 | ENST00000630150 | 649 nt | TSL 5 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR3974-201 | ENST00000637126 | 96 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTND4P4-201 | ENST00000439033 | 1366 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | Y_RNA.77-201 | ENST00000362962 | 107 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-343P-201 | ENST00000364709 | 104 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | SNORA51.11-201 | ENST00000384442 | 131 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-342P-201 | ENST00000384521 | 104 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | TRAJ17-201 | ENST00000390520 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL590084.2-201 | ENST00000401481 | 382 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6ATAC38P-201 | ENST00000408119 | 126 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC00392-201 | ENST00000430033 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | TRIM60P8Y-201 | ENST00000436338 | 762 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL39P40-201 | ENST00000445481 | 146 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC034222.1-201 | ENST00000494052 | 532 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC008243.1-202 | ENST00000506527 | 481 nt | TSL 5 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTND4LP22-201 | ENST00000508209 | 276 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC116347.2-201 | ENST00000514912 | 523 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AP004371.1-201 | ENST00000525240 | 214 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MS4A4E-204 | ENST00000526086 | 460 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL355773.1-201 | ENST00000554458 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC012379.1-201 | ENST00000558304 | 406 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL513324.1-201 | ENST00000575236 | 632 nt | TSL 5 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR3921-201 | ENST00000577308 | 85 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | CLPTM1LP1-201 | ENST00000604519 | 484 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL23AP88-201 | ENST00000605759 | 454 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |