Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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UBE4AQ14139 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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UBE4AQ14139 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBE4AQ14139 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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