Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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COL9A3Q14050 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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COL9A3Q14050 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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