Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KCNC3Q14003 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms