Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms