| RUNX2 | Q13950 | snoU13.22-201 | ENST00000459428 | 104 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL163973.1-201 | ENST00000484753 | 577 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL39P36-201 | ENST00000490784 | 156 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC074124.1-201 | ENST00000502368 | 375 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079467.1-201 | ENST00000508512 | 503 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104806.1-201 | ENST00000508720 | 308 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4ATAC8P-201 | ENST00000516196 | 109 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | DLEU1_1.1-201 | ENST00000618107 | 190 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C4orf22-209 | ENST00000621014 | 228 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ABCC9-206 | ENST00000621589 | 450 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC006111.3-201 | ENST00000622137 | 383 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068544.1-201 | ENST00000635064 | 248 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNJ16-203 | ENST00000392671 | 3981 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIAA1109-203 | ENST00000388738 | 15574 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYSLTR2-201 | ENST00000282018 | 4672 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM35BP-202 | ENST00000497389 | 3337 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CKAP2P1-201 | ENST00000555477 | 2049 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093274.1-201 | ENST00000503488 | 5454 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513302.2-201 | ENST00000562313 | 1842 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAPGEF6-202 | ENST00000308008 | 4176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NR3C1-212 | ENST00000504572 | 3389 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359693.1-201 | ENST00000614959 | 2407 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GEN1-201 | ENST00000317402 | 9854 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MME-211 | ENST00000492661 | 2854 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ABCC9-202 | ENST00000261201 | 4650 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010680.1-201 | ENST00000590024 | 3590 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP50-201 | ENST00000363731 | 107 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY3P3-201 | ENST00000363816 | 102 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD46.1-201 | ENST00000364139 | 104 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR591-201 | ENST00000385290 | 95 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-550P-201 | ENST00000391057 | 101 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-387P-201 | ENST00000411331 | 105 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BX323014.1-201 | ENST00000412876 | 237 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EEF1A1P40-201 | ENST00000412883 | 573 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z99755.1-201 | ENST00000414048 | 380 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012498.1-201 | ENST00000424037 | 437 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P46-201 | ENST00000425129 | 740 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001117.1-201 | ENST00000428205 | 609 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000907.1-201 | ENST00000428428 | 510 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P27-201 | ENST00000431429 | 603 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157882.1-201 | ENST00000447148 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL844175.1-201 | ENST00000455153 | 323 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069439.1-201 | ENST00000494739 | 167 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109927.2-201 | ENST00000506416 | 303 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006445.2-201 | ENST00000510061 | 472 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-914P-201 | ENST00000516749 | 109 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P35-201 | ENST00000526739 | 508 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLEC2D-214 | ENST00000543300 | 399 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLEC2D-216 | ENST00000545918 | 288 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021979.1-201 | ENST00000553822 | 336 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4801-201 | ENST00000582704 | 82 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007001.1-201 | ENST00000590912 | 670 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012313.1-202 | ENST00000597309 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR15A-201 | ENST00000607334 | 83 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DCAF17-212 | ENST00000611110 | 975 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZGRF1-212 | ENST00000612287 | 2176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM214A-216 | ENST00000619572 | 3548 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EBAG9-210 | ENST00000620557 | 2186 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRTM2-201 | ENST00000274711 | 6017 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356274.2-201 | ENST00000624379 | 3752 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IQCG-205 | ENST00000455191 | 1981 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SERPINI2-202 | ENST00000461846 | 1514 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPA8P4-201 | ENST00000511877 | 1920 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PKHD1L1-201 | ENST00000378402 | 13076 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MBNL1-223 | ENST00000498502 | 5258 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PROS1-203 | ENST00000407433 | 3335 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNF17-204 | ENST00000339524 | 2203 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP197-201 | ENST00000363357 | 119 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.453-201 | ENST00000384223 | 109 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1035P-201 | ENST00000384477 | 107 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02337-201 | ENST00000401043 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP111-201 | ENST00000410349 | 271 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1068P-201 | ENST00000410958 | 103 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P23-201 | ENST00000416931 | 372 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC106873.1-201 | ENST00000420664 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114808.2-201 | ENST00000428335 | 536 nt | TSL 4 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CALM2P2-201 | ENST00000428512 | 440 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | YME1L1P1-201 | ENST00000429435 | 297 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL592045.1-201 | ENST00000429867 | 352 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P2-201 | ENST00000430604 | 821 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL159987.2-201 | ENST00000432754 | 307 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P25-201 | ENST00000441039 | 533 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012070.1-201 | ENST00000442062 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00571-203 | ENST00000454060 | 525 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P49-201 | ENST00000471402 | 708 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02198-202 | ENST00000505371 | 526 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02061-201 | ENST00000514225 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02374-202 | ENST00000515222 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP401-201 | ENST00000515920 | 127 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |