| RUNX3 | Q13761 | ATXN3L-201 | ENST00000380622 | 2164 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HTR2B-201 | ENST00000258400 | 2246 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMPRSS11A-201 | ENST00000334830 | 3054 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | API5P2-201 | ENST00000397055 | 1498 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091534.1-201 | ENST00000548779 | 1751 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MLIP-AS1-201 | ENST00000434196 | 1534 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF117-204 | ENST00000620222 | 5317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093725.1-201 | ENST00000508135 | 2672 nt | TSL 5 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HERC4-201 | ENST00000277817 | 4371 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU5A-8P-201 | ENST00000364102 | 114 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-173P-201 | ENST00000364215 | 104 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-65P-201 | ENST00000410473 | 140 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073626.1-201 | ENST00000415146 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009158.1-206 | ENST00000417476 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ISCA1P6-201 | ENST00000427740 | 390 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf59P1-201 | ENST00000429930 | 303 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL358934.1-201 | ENST00000432346 | 324 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112518.1-201 | ENST00000436089 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TIMM9P1-201 | ENST00000436122 | 256 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL35AP22-201 | ENST00000436855 | 335 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAJC19P4-201 | ENST00000440115 | 345 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092473.1-201 | ENST00000441098 | 221 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR217HG-201 | ENST00000446139 | 900 nt | TSL 5 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114485.1-201 | ENST00000447916 | 657 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01691-201 | ENST00000450546 | 426 nt | TSL 5 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HTR2A-AS1-202 | ENST00000452352 | 384 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFAF4P4-201 | ENST00000454883 | 502 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GRM7-AS3-209 | ENST00000458713 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU109.1-201 | ENST00000459339 | 135 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01323-201 | ENST00000486767 | 576 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRIP1-201 | ENST00000489235 | 288 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | YWHAEP4-201 | ENST00000505390 | 198 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008549.1-201 | ENST00000512900 | 643 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.672-201 | ENST00000516289 | 104 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003392.2-201 | ENST00000527269 | 208 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104237.1-201 | ENST00000527443 | 539 nt | TSL 4 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091047.1-201 | ENST00000533344 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02300-201 | ENST00000549742 | 665 nt | TSL 4 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092718.6-202 | ENST00000563072 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025917.1-202 | ENST00000566344 | 635 nt | TSL 5 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC055876.1-202 | ENST00000567053 | 138 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3146-201 | ENST00000580367 | 79 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC127024.3-201 | ENST00000582841 | 460 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB131E-202 | ENST00000602581 | 683 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004908.2-201 | ENST00000609090 | 574 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MALAT1-206 | ENST00000612781 | 234 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004696.1-201 | ENST00000614345 | 607 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108479.2-201 | ENST00000617314 | 601 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC095031.1-201 | ENST00000623685 | 672 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355596.1-201 | ENST00000565399 | 3996 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCOC-202 | ENST00000394201 | 1795 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01419-201 | ENST00000522365 | 1521 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RTL4-201 | ENST00000340433 | 2613 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | APCS-201 | ENST00000255040 | 926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP226-201 | ENST00000364912 | 300 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390198.1-201 | ENST00000376445 | 320 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CRLS1-202 | ENST00000378868 | 994 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-432P-201 | ENST00000384196 | 109 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.516-201 | ENST00000384541 | 124 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL109755.1-201 | ENST00000401791 | 649 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LHFPL3-AS1-203 | ENST00000417290 | 950 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX295541.1-201 | ENST00000417774 | 250 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP9YP20-201 | ENST00000419224 | 558 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABCC5-AS1-201 | ENST00000422946 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL31P35-201 | ENST00000431058 | 377 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356277.3-201 | ENST00000432484 | 618 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005019.2-201 | ENST00000434321 | 359 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL122017.1-201 | ENST00000435858 | 784 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011816.1-201 | ENST00000441346 | 546 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP1-201 | ENST00000454315 | 1119 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359095.1-201 | ENST00000457383 | 635 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-59P-201 | ENST00000459101 | 61 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136537.1-201 | ENST00000508199 | 538 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104233.2-201 | ENST00000518922 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERHP1-201 | ENST00000523006 | 310 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SDHAF2-203 | ENST00000534878 | 523 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068993.2-201 | ENST00000546563 | 395 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049869.2-201 | ENST00000556634 | 365 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF1P4-201 | ENST00000572664 | 335 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105224.1-201 | ENST00000587055 | 421 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001029.3-201 | ENST00000588063 | 596 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL022154.1-201 | ENST00000604698 | 785 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000860.1-201 | ENST00000605250 | 559 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-87P-201 | ENST00000607561 | 108 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245517.5-201 | ENST00000611529 | 162 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNRD1-AS1_3.8-201 | ENST00000611686 | 104 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TUG1_2.1-201 | ENST00000614234 | 87 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TFG-209 | ENST00000615993 | 1244 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDKN2B-AS.1-201 | ENST00000617921 | 150 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068880.5-201 | ENST00000624331 | 290 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136313.1-201 | ENST00000624804 | 202 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PISRT1-201 | ENST00000626175 | 531 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MARCH6-215 | ENST00000640713 | 231 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P26-201 | ENST00000426018 | 1752 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092447.7-201 | ENST00000422212 | 1621 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BCLAF1-205 | ENST00000527536 | 5371 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP57L1-203 | ENST00000368970 | 1680 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGS13-204 | ENST00000543215 | 1518 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF883-201 | ENST00000619044 | 2051 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANKRD36C-201 | ENST00000295246 | 2272 nt | TSL 5 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |