Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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