Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
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MKRN4PQ13434 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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