Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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