Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTGDRQ13258 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms