Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms