Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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GPS1Q13098 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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GPS1Q13098 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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GPS1Q13098 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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GPS1Q13098 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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