Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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GRIK3Q13003 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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GRIK3Q13003 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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GRIK3Q13003 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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GRIK3Q13003 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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GRIK3Q13003 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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GRIK3Q13003 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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