Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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BNIP3Q12983 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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