Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms