Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFSWAPQ12872 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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