Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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