Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
TTPAP49638 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
TTPAP49638 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TTPAP49638 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TTPAP49638 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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