Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRMP28827 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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PTPRMP28827 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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PTPRMP28827 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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PTPRMP28827 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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