Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
J3KRW8 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
J3KRW8 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
J3KRW8 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
J3KRW8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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