Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms