Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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UHRF1Q96T88 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UHRF1Q96T88 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UHRF1Q96T88 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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UHRF1Q96T88 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
UHRF1Q96T88 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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