Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMG1Q96Q15 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
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