Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms