Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
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ZNF548Q8NEK5 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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ZNF548Q8NEK5 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZNF548Q8NEK5 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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