Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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