Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPROQ16827 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPROQ16827 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPROQ16827 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPROQ16827 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PTPROQ16827 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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