Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FXNQ16595 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
FXNQ16595 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FXNQ16595 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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FXNQ16595 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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FXNQ16595 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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FXNQ16595 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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FXNQ16595 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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FXNQ16595 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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FXNQ16595 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FXNQ16595 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FXNQ16595 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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