Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms