Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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CHD4Q14839 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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CHD4Q14839 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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CHD4Q14839 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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CHD4Q14839 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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