Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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